Qsep Bio-Fragment Analyzer: NGS Library Validierung mit Hilfe automatisierter Kapillar-Gelelektrophorese

Eine gute Vorbereitung ist der wichtigste Schritt im NGS-Workflow (NGS (Next Generation Sequencing). Die Präparation von DNA-Fragmenten bestimmter Größen ist die Grundlage hochwertiger Analysen. Daher ist die Überwachung der Stichprobengröße und -qualität der NGS-Bibliothek von größter Bedeutung.

Die folgende Publikation (mehr lesen >>>) zeigt, wie der vollautomatisierte Qsep100 Biofragment Analyzer (mehr lesen >>>) zum Nachweis kleinster NGS Library-Proben (bis zu einer Grenze von 50 pg) verwendet wird. Das Qsep100-System wurde verwendet, um jeden Schritt des NGS Library Vorbereitungs-Workflows zu überwachen, von der Upstream-Genom-DNA über die Gesamt-RNA bis zum letzten Schritt der DNA-Bibliothek.

Der Qsep100-Analysator überzeugt z. B. durch: einfache Handhabung + innovative Mikrokapillar-Elektrophorese-Technologie mit gebrauchsfertigen und austauschbaren Gelkartuschen + hohe Auflösung und hohen Durchsatz + reduzierte Kosten des Instruments und auch der Kosten pro Probenanalyse.

Qsep-NGS-Pub-Figure4


Publikation: American Laboratory, 2016/11, V. Amirkhanian et al. (Link)

Next-generation sequencing (NGS) is widely used in genomics, epigenetics and transcriptomics, etc.,1 and also in such clinical diagnostics applications as cancer screening and drug development.2 There are multiple commercial NGS platforms available, each incorporating unique operating principles (e.g., Roche 454FLX [454 Life Sciences, Branford, Conn.], Illumina Genome Sequencer3 [Illumina Inc., San Diego, Calif.] and Applied Biosystems/ABI SOLiD Sequencer [Foster City,Calif.]). No matter the platform, library preparation is the most critical step in the NGS workflow.

Zur Publikation >>>

Referenzen

  1. Metzker, M.H. Sequencing technologies—the next generation. Nat. Rev. Genetics 2010, 11, 31–46.
  2. Desai, A.N. and Jere, A. Next-generation sequencing: ready for the clinics? Clin. Genetics  2012, 81, 503–10.
  3. Quail, M.A.; Kozarewa, I. et al. A large genome center’s improvements to the Illumina sequencing system. Nat. Methods  20085, 1005–10.

Qsep Bio-Fragment Analyzer

Hier mehr erfahren >>>

Qsep100

Back to Blog

Related Articles

Der Bio-Fragment Analyzer − Starke Hilfe im Labor!

Seit letztem Jahr bietet NIPPON Genetics EUROPE mit dem Qsep Bio-Fragment Analyzer ein großartiges...

FAS-DIGI Compact - Kompaktes Design mit leistungsstarken Funktionen

Die FAS-DIGI Compact ist unser neues...

FastGene Plattenzentrifuge - Dein leiser Platten Freund