Eine gute Vorbereitung ist der wichtigste Schritt im NGS-Workflow (NGS (Next Generation Sequencing). Die Präparation von DNA-Fragmenten bestimmter Größen ist die Grundlage hochwertiger Analysen. Daher ist die Überwachung der Stichprobengröße und -qualität der NGS-Bibliothek von größter Bedeutung.
Die folgende Publikation (mehr lesen >>>) zeigt, wie der vollautomatisierte Qsep100 Biofragment Analyzer (mehr lesen >>>) zum Nachweis kleinster NGS Library-Proben (bis zu einer Grenze von 50 pg) verwendet wird. Das Qsep100-System wurde verwendet, um jeden Schritt des NGS Library Vorbereitungs-Workflows zu überwachen, von der Upstream-Genom-DNA über die Gesamt-RNA bis zum letzten Schritt der DNA-Bibliothek.
Der Qsep100-Analysator überzeugt z. B. durch: einfache Handhabung + innovative Mikrokapillar-Elektrophorese-Technologie mit gebrauchsfertigen und austauschbaren Gelkartuschen + hohe Auflösung und hohen Durchsatz + reduzierte Kosten des Instruments und auch der Kosten pro Probenanalyse.
Publikation: American Laboratory, 2016/11, V. Amirkhanian et al. (Link)
Next-generation sequencing (NGS) is widely used in genomics, epigenetics and transcriptomics, etc.,1 and also in such clinical diagnostics applications as cancer screening and drug development.2 There are multiple commercial NGS platforms available, each incorporating unique operating principles (e.g., Roche 454FLX [454 Life Sciences, Branford, Conn.], Illumina Genome Sequencer3 [Illumina Inc., San Diego, Calif.] and Applied Biosystems/ABI SOLiD Sequencer [Foster City,Calif.]). No matter the platform, library preparation is the most critical step in the NGS workflow.
Referenzen
- Metzker, M.H. Sequencing technologies—the next generation. Nat. Rev. Genetics 2010, 11, 31–46.
- Desai, A.N. and Jere, A. Next-generation sequencing: ready for the clinics? Clin. Genetics 2012, 81, 503–10.
- Quail, M.A.; Kozarewa, I. et al. A large genome center’s improvements to the Illumina sequencing system. Nat. Methods 2008, 5, 1005–10.
Qsep Bio-Fragment Analyzer
